Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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