Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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