Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TNXAQ16473 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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