Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms