Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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GRIK4Q16099 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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GRIK4Q16099 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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