Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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