Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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NFIXQ14938 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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NFIXQ14938 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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NFIXQ14938 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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NFIXQ14938 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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NFIXQ14938 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIXQ14938 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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