Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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SPIDRQ14159 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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SPIDRQ14159 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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