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| RUNX3 | Q13761 | MTND5P13-201 | ENST00000513046 | 1079 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM60DP-201 | ENST00000524174 | 632 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007115.1-201 | ENST00000546853 | 234 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1B2P4-201 | ENST00000551398 | 348 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359237.1-201 | ENST00000554305 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355773.1-201 | ENST00000554458 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC073114.1-201 | ENST00000612027 | 490 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7844-201 | ENST00000616161 | 122 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C3orf49-203 | ENST00000616659 | 876 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068137.4-201 | ENST00000638485 | 296 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MCF2-208 | ENST00000519895 | 3346 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356473.1-201 | ENST00000406203 | 1408 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RASSF8-210 | ENST00000541490 | 5505 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF117-203 | ENST00000610793 | 1374 nt | TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPR34-201 | ENST00000378138 | 1815 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LY96-201 | ENST00000284818 | 607 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CXCL10-201 | ENST00000306602 | 1176 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA31-201 | ENST00000362607 | 130 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP383-201 | ENST00000362934 | 120 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.97-201 | ENST00000363094 | 102 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD56.3-201 | ENST00000363507 | 71 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RABGGTB-202 | ENST00000370826 | 512 nt | TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM107B-204 | ENST00000378465 | 1052 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RFX3-203 | ENST00000381984 | 364 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-821P-201 | ENST00000390995 | 107 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360182.1-201 | ENST00000397433 | 468 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MOB4-205 | ENST00000409916 | 829 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU2-15P-201 | ENST00000410692 | 191 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BTF3L4P1-201 | ENST00000413813 | 468 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC002381.1-201 | ENST00000447049 | 280 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND1P29-201 | ENST00000448112 | 647 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL163192.1-201 | ENST00000448858 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL365295.1-201 | ENST00000454942 | 514 nt | TSL 5 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL31P3-201 | ENST00000458430 | 332 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LEKR1-206 | ENST00000483177 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL633P-201 | ENST00000488974 | 297 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001025.2-201 | ENST00000490908 | 477 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008652.1-201 | ENST00000505261 | 469 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02465-201 | ENST00000507099 | 532 nt | TSL 4 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093809.1-201 | ENST00000509155 | 340 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103957.1-202 | ENST00000519814 | 735 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107909.2-201 | ENST00000520844 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009597.1-201 | ENST00000521215 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MS4A13-204 | ENST00000527948 | 790 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UNC13C-202 | ENST00000539562 | 938 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092354.1-201 | ENST00000606057 | 376 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103710.4-201 | ENST00000609301 | 899 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008121.2-201 | ENST00000614647 | 523 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U73479.1-201 | ENST00000618062 | 168 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BIRC6-AS2-201 | ENST00000623382 | 589 nt | TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091925.2-201 | ENST00000625059 | 256 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | INPP4B-223 | ENST00000630044 | 354 nt | TSL 5 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGHVIII-44-202 | ENST00000636235 | 289 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LEPR-202 | ENST00000349533 | 8227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MGAT4C-202 | ENST00000548651 | 2159 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYOT-202 | ENST00000421631 | 1474 nt | TSL 2 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CACNB4-222 | ENST00000636350 | 7654 nt | TSL 5 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR52E6-201 | ENST00000329322 | 970 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-82P-201 | ENST00000362443 | 140 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP189-201 | ENST00000364920 | 115 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD51-201 | ENST00000384320 | 80 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR196B-201 | ENST00000384852 | 84 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445529.1-201 | ENST00000398713 | 389 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL583834.1-201 | ENST00000406943 | 343 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP1R1C-203 | ENST00000409702 | 1157 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-78P-201 | ENST00000410940 | 126 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTATP6P27-201 | ENST00000416987 | 621 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX119904.4-201 | ENST00000424402 | 301 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL391336.1-201 | ENST00000424678 | 484 nt | TSL 3 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003084.1-201 | ENST00000427030 | 435 nt | TSL 5 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010153.1-201 | ENST00000432862 | 727 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB6C-AS1-202 | ENST00000433431 | 123 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP45-201 | ENST00000435243 | 565 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RSU1P2-202 | ENST00000437884 | 485 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPEP7-201 | ENST00000438350 | 220 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LSM1P1-201 | ENST00000438629 | 273 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KATNBL1P3-201 | ENST00000443475 | 909 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112653.1-201 | ENST00000443851 | 386 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360221.1-201 | ENST00000445989 | 335 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01813-201 | ENST00000451034 | 712 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPTE2P5-203 | ENST00000458118 | 728 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |