Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DNASE1L3Q13609 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms