Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAMK2BQ13554 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms