Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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