Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTP4A2Q12974 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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