Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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FOXF1Q12946 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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FOXF1Q12946 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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FOXF1Q12946 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF1Q12946 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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