Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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