Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWF1Q12792 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWF1Q12792 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWF1Q12792 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TWF1Q12792 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TWF1Q12792 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TWF1Q12792 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TWF1Q12792 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TWF1Q12792 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TWF1Q12792 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TWF1Q12792 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.9 ms