Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms