Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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PTPRAP18433 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PTPRAP18433 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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PTPRAP18433 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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