Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms