Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
EHD3Q9NZN3 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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