Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms