Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms