Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC012574.1-201ENST00000523874 252 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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