Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPROQ16827 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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