Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms