Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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