Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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