Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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