Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNA6Q15825 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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