Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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