Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms