Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms