Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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