Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CBFBQ13951 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CBFBQ13951 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CBFBQ13951 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CBFBQ13951 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CBFBQ13951 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CBFBQ13951 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CBFBQ13951 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms