Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NAE1Q13564 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms