Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms