Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ATRQ13535 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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