Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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