Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATMQ13315 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATMQ13315 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATMQ13315 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATMQ13315 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATMQ13315 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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