Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DUSP4Q13115 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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