Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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