Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms