Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CPSF1Q10570 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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