Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms