Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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PTPRAP18433 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRAP18433 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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