Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSO75390 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSO75390 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CSO75390 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms