Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRTM2O43300 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms