Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms