Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic1Q9Z1Q5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms