Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms